mgr Katarzyna Markowska

Realizowane projekty

1. Aplikacja „Szklane pułapki” na urządzenia mobilne z systemem Android (we współpracy z Fundacją „Szklane Pułapki” oraz  Zespołem Szkół Komunikacji im. H. Cegielskiego w Poznaniu)
2. Aplikacja do monitoringu bocianów na urządzenia mobilne z systemem Android (we współpracy z Uniwersytetem Przyrodniczym w Poznaniu oraz  Zespołem Szkół Komunikacji im. H. Cegielskiego w Poznaniu)
3. Konsekwencje korzystania z informacji socjalnej na poziomie populacyjnym: podejście semi-eksperymentalne (Narodowe Centrum Nauki, grant nr 2018/29/B/NZ8/00066, wykonawca)
4. Outlier detection in biodiversity monitoring data (grant obliczeniowy PCSS nr 403)

Zakończone projekty

1. Ewolucja specjalizacji i dyspersji w dwukierunkowym eksperymencie selekcyjnym na przykładzie inwazyjnego roztocza Aceria tosichella (Narodowe Centrum Nauki grant nr 2016/21/B/NZ8/00786, wykonawca)
2. Kompromisy ewolucyjne w procesie specjalizacji żywicielskiej na przykładzie inwazyjnego roztocza Aceria tosichella (grant NCN nr 2017/27/N/NZ8/00305, wykonawca)
3. Wpływ drapieżnictwa kota domowego na populacje dzikich ptaków w Polsce (projekt nr 001/34/UAM/0004 w ramach programu „Inicjatywa Doskonałości – Uczelnia Badawcza”, kierownik)
4. rangr: An R package for mechanistic, spatially explicit simulation of species range dynamics (projekt magisterski)
5. Ocena przydatności metod uczenia maszynowego do modelowania zmienności przestrzennej zagęszczenia populacji pospolitych gatunków ptaków (projekt licencjacki)
6. Mechanizmy unikania homozygotyczności podczas dyspersji u haplodiploidalnych rotoczy (Grant Dziekana Wydziału Biologii UAM nr GDWB-07/2018, wykonawca)

CV

• 2020 – obecnie: Szkoła Doktorska Nauk Przyrodniczych, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu
• 2020: Tytuł magistra bioinformatyki, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu oraz Politechnika Poznańska
• 2018: Tytuł licencjata bioinformatyki, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu oraz Politechnika Poznańska

Warsztaty, staże i praktyki

• 2023:  Introduction to GLMs with spatial, and spatial-temporal correlation using R-INLA – kurs stacjonarny organizowany przez Highland Statistics Ltd
• 2023: SGroup Blended Intensive Programme (BIP) on Doctoral Education – (20-25.09.2023 – online, 02-06.10.2023 – seminarium stacjonarne), University of Valladolid, Hiszpania
• 2022: ISEC2022 International Statistical Ecology Conference – warsztaty „Hierarchical modeling with nimble” i „Advances in quantifying space-use and habitat-selection of animals”
• 2021: YoMos Workshop 2021 (Young Modellers in Ecology – working group of The Ecological Society of Germany, Austria and Switzerland – GfÖ)
• 2020: vISEC2020 International Statistical Ecology Conference – warsztaty „Level Up your R Package”
• 2020: YoMos Workshop 2020 (Young Modellers in Ecology – working group of The Ecological Society of Germany, Austria and Switzerland – GfÖ)
• 2019: „Agend-based and Individual-based modelling using NetLogo” – kurs na uniwersytecie w Berlinie (FU Berlin)
• 2019: „Wprowadzenie do obliczeń na EAGLE (PRACE Tier-1)” – szkolenie w Poznańskim Centrum Superkomputerowo-Sieciowym
• 2017: Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe (praktyka studencka)

Nagrody i wyróżnienia

• 2019: Stypendium rektora dla najlepszych studentów UAM
• 2017: Stypendium rektora dla najlepszych studentów UAM
• 2016: Stypendium rektora dla najlepszych studentów UAM

2022

ISEC2022 International Statistical Ecology Conference, 27.06-01.07.2022, prezentacja on-line „rangr: An r package for simulating range dynamics of virtual species”, Katarzyna Markowska, Katarzyna Malinowska, Lechosław Kuczyński

Polish Evolutionary Conference, Toruń, 19.09 – 21.09.2022, poster „rangr: An r package for simulating range dynamics of virtual species”, Katarzyna Markowska, Katarzyna Malinowska, Lechosław Kuczyński

2021

Young Modellers in Ecology Workshop, prezentacja on-line w czasie rzeczywistym „An R package for mechanistic, spatially explicit simulation of species range dynamics”

Konferencja „Forum Doktoranckie”, prezentacja on-line w czasie rzeczywistym „Metody badania interakcji biotycznych na podstawie szeregów czasowych opisujących dynamikę metapopulacji”

2020

Young Modellers in Ecology Workshop, prezentacja on-line w czasie rzeczywistym „Methods and examples of tools for modelling species range dynamics”

2019

Vth International Conference on Research and Education in Poznań, poster „The evaluation of different machine learning methods for building spatial distribution models of common bird species”

Konferencja Analiza Zagadnienia, Analiza Wyników – Wystąpienie Młodego Naukowca, prezentacja ustna „Uczenie maszynowe w predyktywnym modelowaniu rozmieszczenia zwierząt” (wyróżnienie)

Konferencja Analiza Zagadnienia, Analiza Wyników – Wystąpienie Młodego Naukowca, poster „Ocena przydatności metod uczenia maszynowego do modelowania zagęszczenia populacji ptaków”

Wirtualna Konferencja Młodych Przyrodników, prezentacja wideo „Jak budować modele przestrzennego rozmieszczenia zwierząt?” (wyróżnienie)

Obecnie prowadzone ćwiczenia

1. Programowanie w R

Wcześniej prowadzone ćwiczenia

1. Metody statystyczne w ochronie środowiska
2. Modelowanie procesów ekologicznych
3. Środowisko LINUX i języki skryptowe

2023

Malinowska, K., Markowska, K., & Kuczyński, L. 2023. Making virtual species less virtual by reverse engineering of spatiotemporal ecological models. Methods in Ecology and Evolution 14(9): 2376–2389. https://doi.org/10.1111/2041-210X.14176