mgr Katarzyna Markowska

Realizowane projekty

1. Aplikacja „Szklane pułapki” na urządzenia mobilne z systemem Android (we współpracy z Fundacją „Szklane Pułapki” oraz  Zespołem Szkół Komunikacji im. H. Cegielskiego w Poznaniu)
2. Aplikacja do monitoringu bocianów na urządzenia mobilne z systemem Android (we współpracy z Uniwersytetem Przyrodniczym w Poznaniu oraz  Zespołem Szkół Komunikacji im. H. Cegielskiego w Poznaniu)
3. Konsekwencje korzystania z informacji socjalnej na poziomie populacyjnym: podejście semi-eksperymentalne (Narodowe Centrum Nauki, grant nr 2018/29/B/NZ8/00066, wykonawca)
4. Outlier detection in biodiversity monitoring data (grant obliczeniowy PCSS nr 403)

Zakończone projekty

1. Ewolucja specjalizacji i dyspersji w dwukierunkowym eksperymencie selekcyjnym na przykładzie inwazyjnego roztocza Aceria tosichella (Narodowe Centrum Nauki grant nr 2016/21/B/NZ8/00786, wykonawca)
2. Kompromisy ewolucyjne w procesie specjalizacji żywicielskiej na przykładzie inwazyjnego roztocza Aceria tosichella (grant NCN nr 2017/27/N/NZ8/00305, wykonawca)
3. Wpływ drapieżnictwa kota domowego na populacje dzikich ptaków w Polsce (projekt nr 001/34/UAM/0004 w ramach programu „Inicjatywa Doskonałości – Uczelnia Badawcza”, kierownik)
4. rangr: An R package for mechanistic, spatially explicit simulation of species range dynamics (projekt magisterski)
5. Ocena przydatności metod uczenia maszynowego do modelowania zmienności przestrzennej zagęszczenia populacji pospolitych gatunków ptaków (projekt licencjacki)
6. Mechanizmy unikania homozygotyczności podczas dyspersji u haplodiploidalnych rotoczy (Grant Dziekana Wydziału Biologii UAM nr GDWB-07/2018, wykonawca)

CV

• 2020 – obecnie: Szkoła Doktorska Nauk Przyrodniczych, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu
• 2020: Tytuł magistra bioinformatyki, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu oraz Politechnika Poznańska
• 2018: Tytuł licencjata bioinformatyki, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu oraz Politechnika Poznańska

Warsztaty, staże i praktyki

• 2024: SGroup Blended Intensive Programme (BIP) on Doctoral Education – (9-11.09.2024 – online, 23-27.09.2024 – seminarium stacjonarne), University of Split, Croatia
• 2023:  Introduction to GLMs with spatial, and spatial-temporal correlation using R-INLA – kurs stacjonarny organizowany przez Highland Statistics Ltd
• 2023: SGroup Blended Intensive Programme (BIP) on Doctoral Education – (20-25.09.2023 – online, 02-06.10.2023 – seminarium stacjonarne), University of Valladolid, Hiszpania
• 2022: ISEC2022 International Statistical Ecology Conference – warsztaty „Hierarchical modeling with nimble” i „Advances in quantifying space-use and habitat-selection of animals”
• 2021: YoMos Workshop 2021 (Young Modellers in Ecology – working group of The Ecological Society of Germany, Austria and Switzerland – GfÖ)
• 2020: vISEC2020 International Statistical Ecology Conference – warsztaty „Level Up your R Package”
• 2020: YoMos Workshop 2020 (Young Modellers in Ecology – working group of The Ecological Society of Germany, Austria and Switzerland – GfÖ)
• 2019: „Agend-based and Individual-based modelling using NetLogo” – kurs na uniwersytecie w Berlinie (FU Berlin)
• 2019: „Wprowadzenie do obliczeń na EAGLE (PRACE Tier-1)” – szkolenie w Poznańskim Centrum Superkomputerowo-Sieciowym
• 2017: Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe (praktyka studencka)

Nagrody i wyróżnienia

• 2019: Stypendium rektora dla najlepszych studentów UAM
• 2017: Stypendium rektora dla najlepszych studentów UAM
• 2016: Stypendium rektora dla najlepszych studentów UAM

Obecnie prowadzone ćwiczenia

1. Programowanie w R

Wcześniej prowadzone ćwiczenia

1. Metody statystyczne w ochronie środowiska
2. Modelowanie procesów ekologicznych
3. Środowisko LINUX i języki skryptowe

2026

Katarzyna Markowska, Michał Wawrzynowicz , Lechosław Kuczyńsk, preprint, mrangr: An R package for mechanistic simulation of metacommunities, EcoEvoRixv, https://doi.org/10.32942/X2FQ0W

Katarzyna Malinowska, Michał Wawrzynowicz, Katarzyna Markowska, Tomasz Chodkiewicz, Simon Butler, Lechosław Kuczyński. preprint, Comparing analytical protocols for identifying causes of population changes, bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2025.05.17.654658

2025

2023

Malinowska, K., Markowska, K., & Kuczyński, L. 2023. Making virtual species less virtual by reverse engineering of spatiotemporal ecological models. Methods in Ecology and Evolution 14(9): 2376–2389. https://doi.org/10.1111/2041-210X.14176